《轩辕剑六》的故事背景跨越了商周两个朝代。在公元前1046年，历史上著名的牧野之战爆发。西方周人领袖——周武王姬发，趁天下共主——商纣王子受派出朝廷大军去远征东南方淮夷之际，率领西方诸侯，在孟津联盟会师，闪电袭击防卫空虚的商都——朝歌。年老的纣王措手不及，在鹿台上自焚而死，立国六百年的商朝至此灭亡——历史名义上似乎进入了”周朝”这个新纪元。然而，牧野大战之后，商族仍保留着部分兵力，退守到商族发源地——东部一带，企图反抗。至于纣王之子——武庚，则被围困在朝歌，周武王名义上给其封地，册封其为殷侯。实则派周武王的三位弟弟将对武庚重重包围，对他严密监视，以防其发生叛乱。对于商族人而言，虽然他们战败了，但并不甘心他们眼中一个毫无文化可言的西戎蛮族——周人，夺走他们的江山及共主地位，而且他们更担忧周人将会导致华夏文化从此辱没。因此，紧张的气氛始终在商、周二族之间弥漫，伴随着周武王的猝逝，周国朝中无主，天下动荡不安，东方与西岐之间的冲突，隐然已箭在弦上。同时另一股力量也在蠢蠢欲动，一场大战即将席卷整个中原。
商人的复国之战能否成功？华夏文明将何去何从？而轩辕剑又将在这场历史的纷争之中扮演什么角色呢？历史的帷幕将缓缓拉开，一切的谜底都将在《轩辕剑六》中揭晓。
游戏特色
1.战斗模式：半回合半即时的战斗制度，并且加入了行动值判断。
2.3D游戏视角可选：传统的锁定视角模式或纯开放的3D视角模式。
3.有两岸合作的全程配音。
4.在轩6中部分场景能被人为破坏（依靠主角的天赋技能，如凤天凌的鬼眼、姬亭的贯鹄、蓉霜的碎岩），而后还会出现全新的道路和支线剧情。另外，支线迷宫中有些迷宫没有怪物，包含各种解谜机关。
5.游戏使用了动作捕捉技术。
6.战斗系统：除了原本的法宝系统（经典法宝都会登场）外，还有加入更丰富完整的护驾系统，以及全新的奇术系统，让战斗的策略应用更具有弹性；主角之间有合体技；战斗中可随时更换队员；可学习怪物技能；没有云之遥的阵型系统；
7.激活游戏需要联网，进入游戏不需全程联网（大陆）。
8.游戏中的水源不再像以往一样只是装饰，玩家可以操控角色进入其中（只要有水的地方，走得到都可以下去逛逛，当然前提是不能淹死的深度）。
9.火焰的光源与人物的投影也会随彼此位置不同而改变，光影效果更加真实。景深效果使视觉能够取得清晰图像范围外的场景有类似失焦模糊感,画面效果也比以往真实立体。
10.场景面积比过去扩大了数倍，同一个场景内行动不再需要反复进入读取画面。
11.辅助系统：脉轮系统、炼妖壶系统、模拟经营类的系统（具体待爆料），没有云之遥地城系统。
12.有伙伴支线，没有支线伙伴。
13.游戏中可以随时调整某程度的难易度。
14.在迷宫需要神秘果和存档点存档。
15.游戏中能自由切换领队，并且是以一人一鬼的形式走地图。
16.有加快人物速度设定。
17.用到怪物的系统有4个以上，其中有护驾系统、骑乘系统。骑乘系统有多种坐骑，在一些较大的城市还会提供马车直达服务，节省玩家的时间。
18.新加入了个换装系统。
19.有进行多周目的系统和成就系统。
20.回归“红绿蓝”（命灵体）的模式。
21.2D头像不用在主线剧情，3D人物表情非常丰富。
22.游戏过程中，可以选择肖像风格进行切换，目前共有唯美与现实两种风格供选择。
23.玩家可以操纵角色与周围的物品、建筑、人物发生真实的碰撞效果，但是在下一次进入场景时，被碰撞到的物品会恢复原样。
24.游戏中5大主角都有一套专属的天赋，天赋在角色加入队伍后即可调换使用，可在所有场景无限次释放！
